Over REMIS+ Werkgroep NextGen Sequencing (NGS)

  • Team of REMIS+ Werkgroep »NextGen Sequencing (NGS)«

Present: Adri van der Zanden, Artur Sabat,Bert Niesters, John Rossen, Lesla Bruijnesteijn, Mirjam Kooistra-Smid, Monika Chlebowicz, Ruud Deurenberg, Theo Schuurs.

Absent: Rianne van Rhee, Richard de Boer (Eerste bijeenkomst: 25 mei 2016).

Projecten

  1. Typering gebaseerd op core-genoom multi-locus sequentie typering (cgMLST)
  2. Ontwikkeling van een uitbraakstam-specifieke real-time PCR
  3. Vaststellen van het resistoom van een bacteriële stam
  4. Ontrafelen van virulentie factoren van bacteriële stammen
  5. Identificatie van bacteriën met behulp van 16-23S sequentieanalyse op direct patiënten materiaal
  6. Identificatie van virussen, bacteriën, fagen, parasieten en schimmels met behulp van metagenomics
  7. Bacteriële plasmide analyses

Request form Next Generation Sequencing [Download]

Protocol voor het indienen van stammen voor moleculaire surveillance van CPE [Download]

Doelstelling:
Regionale capacity building voor het gebruik van next- and next-, next-generation sequencing technologieën in de klinische microbiologie en voor infectiepreventie.

Projectleider:
Prof. dr. John WA Rossen

UMCG:
Hamideh Ahmad
Viktoria Akkerboom
Erik Bathoorn
Yvette Bisselink
Fenna Bosma
Monika Chlebowicz
Natacha Couto
Brigitte Dijkhuizen
Silvia Garcia Cobos
Erwin Raangs
Sigrid Rosema
John Rossen
Artur Sabat
Bhanu Sinha

Certe:
Richard de Boer
Mirjam Kooistra-Smid
Glen Mithoe
Alewijn Ott
Robin Benus
Guido Wisselink
Evert van Zanten

Isala:
Lesla Bruijnesteijn

Izore:
Walter de Boer
Rianne van Rhee
Theo Schuurs

Labmicta:
Adri van der Zanden


Contactpersoon:
John Rossen: j.w.a.rossen@rug.nl | Department of Medical Microbiology
University of Groningen | University Medical Center Groningen
Mailcode EB80 | Hanzeplein 1 | 9713 GZ Groningen | The Netherlands

Documents

Oproep insturen materiaal voor validatie
Oproep 16S-23S rDNA NGS
  Aanvraagformulier 16S-23S rDNA NGS

Alewijn Ott
16S-23S rDNA NGS: meer dan je dacht